第三季开篇，杰克受一位老军医之托，寻找失踪的女儿——一名FBI技术探员。线索指向新奥尔良地下网络，杰克与当地黑帮交火数次。他渐渐发现，这个失踪案是FBI内部一个极端派系“纯净之手”设的局，目的是将他引到一座废弃军事基地进行“合法猎杀”，因为他们认为杰克这种法外执法者是体制的耻辱。杰克与派系头目——曾经的FBI明星探员考德威尔——展开对决。考德威尔同样精通格斗与推理，两人在基地的雷达塔上进行了十十分钟的肉搏。杰克最终利用考德威尔的骄傲，故意露出破绽后反制。他并没有杀考德威尔，而是将整个诱捕计划的证据链曝光给了媒体。最后一幕，杰克独自走在公路上，一辆黑色SUV停在他身边，车窗摇下，一个旧相识说：“总统想见你。”季终。
本季动作场面更上一层楼，监狱与塔楼两场打斗戏可以载入类型史册。反派不是脸谱化的坏人而是镜像对照，增加了深度。每一集都像电影，强烈建议一次性刷完。
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